전국공무원노조는 헌법에 규정된 공무원의 의무를 다하기 위해 부당한 업무지시를 거부하기로 했다. 광우병 쇠고기 홍보지침, 물 사유화, 공공부문 외주위탁, 국립대 법인화, 무분별한 공무원 감원 등 행정의 공공성을 해치고 국민의 건강권을 위협하는 잘못된 정부정책에 대한 행정지침 수행을 거부한다. 공무원의 부당행정 거부운동에도 불구하고 각 지자체장이 부당한 업무지시를 계속할 경우, 공무원노조는 시민들과 함께 주민소환운동을 통해 심판할 것이다. 공무원노조는 민주노총의 '광우병 쇠고기 운송저지 투쟁'에도 적극 결합할 것이다.